Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP4Q969X6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms