Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC12Q8WUD4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC12Q8WUD4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms