Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT1Q8TDG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms