Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDE3

RNASE8, Ribonuclease 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE8Q8TDE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNASE8Q8TDE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNASE8Q8TDE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms