Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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