Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGAP1Q8N6T3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGAP1Q8N6T3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGAP1Q8N6T3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms