Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T0

TOP6BL, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP6BLQ8N6T0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP6BLQ8N6T0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP6BLQ8N6T0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms