Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms