Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP4Q86YS3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP4Q86YS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms