Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms