Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX20Q7Z614 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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