Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNE3Q6ZMZ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms