Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBX2Q6XYB7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX2Q6XYB7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms