Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms