Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC171Q6TFL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms