Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRWD3Q6RI45 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRWD3Q6RI45 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRWD3Q6RI45 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms