Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFXN4Q6P4A7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms