Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 419.67■□□□□ 0.747e-18■■■■■ 46.5
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PRPF8Q6P2Q9 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 415.91■□□□□ 0.147e-18■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 315.12■□□□□ 0.017e-18■■■■■ 46.5
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PRPF8Q6P2Q9 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 46.2
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PRPF8Q6P2Q9 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.13e-16■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.843e-9■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 23.47□□□□□ -1.853e-9■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.863e-9■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.93e-9■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 MMS22L-210ENST00000510018 966 ntTSL 52.54□□□□□ -29e-13■■■■■ 46.2
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-203ENST00000587357 494 ntTSL 421.83■■□□□ 1.081e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-209ENST00000590900 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-207ENST00000589467 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-11■■■■■ 46.1
PRPF8Q6P2Q9 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.491e-11■■■■■ 46.1
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