Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPRIN2Q6IMN6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms