Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG16L1Q676U5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms