Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA1Q5VX52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA1Q5VX52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms