Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms