Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL5Q5HYW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms