Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOM1Q5C9Z4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms