Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF394Q53GI3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms