Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYTL3Q4VX76 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYTL3Q4VX76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYTL3Q4VX76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYTL3Q4VX76 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYTL3Q4VX76 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYTL3Q4VX76 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYTL3Q4VX76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms