Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDRF1Q3B7T1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms