Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWC2Q2TAL6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms