Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRC36Q1X8D7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LRRC36Q1X8D7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LRRC36Q1X8D7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRC36Q1X8D7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms