Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTRK2Q16620 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTRK2Q16620 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms