Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TNXAQ16473 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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