Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC6Q16204 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC6Q16204 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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