Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
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NCOA1Q15788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
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NCOA1Q15788 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
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NCOA1Q15788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
NCOA1Q15788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
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