Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF1Q15637 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF1Q15637 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF1Q15637 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SF1Q15637 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF1Q15637 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF1Q15637 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SF1Q15637 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF1Q15637 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SF1Q15637 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF1Q15637 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF1Q15637 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF1Q15637 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF1Q15637 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SF1Q15637 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF1Q15637 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms