Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RYR3Q15413 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYR3Q15413 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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