Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX17Q15036 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX17Q15036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX17Q15036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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