Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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