Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBFBQ13951 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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