Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB3Q13509 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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