Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTM1Q13496 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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