Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP2Q13309 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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