Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH17Q12864 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH17Q12864 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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