Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFEMP1Q12805 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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