Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.79	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	BUR6	YER159C	429 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	CAP2	YIL034C	864 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.78	□□□□□ -1.8
VIK1	Q12045	HOM2	YDR158W	1098 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PFA5	YDR459C	1125 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	API2	YDR525W	330 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	MOB2	YFL034C-B	864 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YGL199C	YGL199C	471 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RPB3	YIL021W	957 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YKR047W	YKR047W	306 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YGK3	YOL128C	1128 nt		3.77	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PRM2	YIL037C	1971 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	NFI1	YOR156C	2181 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ARO9	YHR137W	1542 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	HSP30	YCR021C	999 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YJL220W	YJL220W	453 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YNL296W	YNL296W	315 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	APE2	YKL157W	2859 nt		3.76	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	CAF16	YFL028C	870 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PNP1	YLR209C	936 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RPL15B	YMR121C	615 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ANT1	YPR128C	987 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	BOI2	YER114C	3123 nt		3.75	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PHO87	YCR037C	2772 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	COS7	YDL248W	1152 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	COS5	YJR161C	1152 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ECM15	YBL001C	315 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YML053C	YML053C	639 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	NTA1	YJR062C	1374 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	CTF18	YMR078C	2226 nt		3.74	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RXT3	YDL076C	885 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YGR079W	YGR079W	1113 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YGR273C	YGR273C	525 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SOD1	YJR104C	465 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YET2	YMR040W	483 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YNR061C	YNR061C	660 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RRP36	YOR287C	903 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.73	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SAF1	YBR280C	1914 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	FAT1	YBR041W	2010 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	BUD27	YFL023W	2391 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	FAD1	YDL045C	921 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	VMA22	YHR060W	546 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	ANB1	YJR047C	474 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	PER33	YLR064W	822 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	CKS1	YBR135W	453 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SLX1	YBR228W	915 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.72	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	MIF2	YKL089W	1650 nt		3.71	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	CNA1	YLR433C	1662 nt		3.71	□□□□□ -1.81
VIK1	Q12045	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	KRE28	YDR532C	1158 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YGR015C	YGR015C	987 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	ACP1	YKL192C	378 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YBL036C	YBL036C	774 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YIM2	YMR151W	438 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	PPA2	YMR267W	933 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	BSD2	YBR290W	966 nt		3.71	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	RNY1	YPL123C	1305 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	CIT1	YNR001C	1440 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.7	□□□□□ -1.82

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