Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SYCNQ0VAF6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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