Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC15Q0P6D6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms