Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf54Q08AI8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms