Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN3Q08043 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN3Q08043 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms