Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51Q06609 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD51Q06609 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms