Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms